Панель "Генетические эпилепсии" включает анализ 560 генов, связанных с синдромами одним из признаков являются судорожные состояния. Это могут быть как синдромы в симптоматике которых судороги являются единственным или ведущим признаком, так и синдромы в которых, также, имеются и другие неврологические (задержка развития, аутизм, изменения структур головного мозга) и не неврологические нарушения (аномалии развития, нарушения обмена веществ и пр).
Виды генетических изменений, определяемых панелью "Генетические эпилепсии":
Однонуклеотидные и мультинуклеотидные варианты (SNV и MNV) в экзонах всех клинически значимых генов;
Малые вставки-делеции (in/del) до 50 пар нуклеотидов в экзонах всех клинически значимых генов;
Вариации числа копий генов (CNV), такие как делеции/микроделеции и дупликации/микродупликации среднего и крупного размера (с ограничениями);
Гены, включенные в панель NGS, отобраны на основе глубокого анализа общих (OMIM, ClinVar, CCDS, Ensembl, GENCODE, miRBase, RefSeq, VEGA) и специализированных (GenEpi, CarpeDB, epiGAD, The Lafora Gene Mutation Database, MeGene) генетических баз данных. В панель также включены некоторые гены-кандидаты, связь которых с эпилепсией вероятна, и гены, ответственные за коморбидные заболевания с задержкой развития, расстройствами аутистического спектра, синдромом дефицита внимания и гиперактивности.
С практической точки зрения обнаружение мутации, вызвавшей развитие эпилепсии, позволяет:
- прекратить дальнейшие дорогостоящие диагностические процедуры;
- более точно прогнозировать течение заболевания;
- оптимизировать терапию (в том числе подобрать «таргетные» препараты);
- исключить или изменить тактику хирургического лечения;
- определить прогноз дальнейшего деторождения.
Список генов и заболеваний, включенных в панель "Наследственные эпилепсии"
Ген Заболевание
AARS Болезнь Шарко-Мари-Тута; ранняя эпилептическая энцефалопатия
ABCC8 Сахарный диабет, инсулинонезависимый; гиперинсулинемическая гипогликемиг
ABCD1 Адренолей кодистрофия; адреномиелоней ропатия
ACADM Дефицит средних цепей Ацил-КоА-дегидрогеназы
ACADS Дефицит коротких цепей Ацил-КоА-дегидрогеназы
ACTB Дистония ювенильная; синдром Барайцера-Уинтера
ACTG1 Синдром Барайцера-Уинтера
ACY1 Дефицит аминоацилазы
ADAR Синдром Айкарди-Гутьереса
ADCK3 Дефицит коэнзима Q1 О
ADGRG1 Билатеральная полимикрогирия
ADGRV1 Семейные фебрильные судороги
ADNP Синдром Хелсмуртела-ван дер АА
ADSL Дефицит аденилосукциназы
AFG3L2 Спастическая атаксия; спиноцеребеллярная атаксия
AGA Аспартилглюкозаминурия
AH11 Синдром Жубер
AIMP1 Гипомиленизирующая лейкодистрофия
AKT3 Синдром мегалэнцефалии полимикрогирии-полидактилиигидроцефалии
ALDH4A1 Гиперпролинемия
ALDH5A1 Дефицит сукцинат-полуальдегид-ди гедрогеназы
ALDH7A1 Пиридоксин-зависимая эпилепсия
ALG1 Врожденное нарушение гликозилирования
ALG11 Врожденное нарушение гликозилирования
ALG12 Врожденное нарушение гликозилирования
ALG13 Врожденное нарушение гликозилирования; ранняя эпилептическая энцефалопатия
ALG2 Врожденное нарушение гликозилирования
ALG3 Врожденное нарушение гликозилирования
ALG6 Врожденное нарушение гликозилирования
ALG8 Врожденное нарушение гликозилирования
ALG9 Врожденное нарушение гликозилирования
AMACR Дефицит альфа-метилацил-КоА рацимазы
AMT Глициновая энцефалопатия
ANK3 Аутосомно-рецессивная умственная отсталость
AP1S2 Х-сцепленная умственная отсталость
APOC3 Дефицит аполипопротеина С-111
APOPT1 Дефицит митохондриального комплекса IV
APTX Атаксия с окуломоторной апраксией и гипоальбуминемией
ARFGEF2Перивентрикулярная гетеротопия с микроцефалией
ARG1 Аргининемия
ARHGEF9Ранняя эпилептическая энцефалопатия
ARL13B Синдром Жубер
ARSA Метахроматическая лейкодистрофия
ARSB Мукополисахаридоз
ARX 308350Ранняя эпилептическая энцефалопатия
ASAH1 Липогранулематоз Фарбера; спинальная мышечная атрофия с прогрессирующей миоклонус-эпилепсией
ASL Аргининосукцинатная ацидурия
ASPA Болезнь Канавана
ASPM Первичная микроцефалия
ASS1 Цитрулинемия
ATIC Рибозидурия
ATN1 Дентаторубральная атрофия
ATP1A2 Мигрень семейная; альтернирующая гемиплегия
ATP1A3 Перемежающаяся детская гемиплегия; дистония
ATP2A2 Болезнь Дарье
ATP5A1 Комбинированный дефицит ферментов комплекса окислительного фосфорилирования
ATP6AP2Паркинсонизм со спастичностью; Х-сцепленная умственная отсталость
ATP7A Болезнь Менкеса; спинальная мышечная атрофия
ATR Синдром Секкеля
ATRX Синдром альфа-талассемия и умственная отсталость; синдром умственная отсталость и гипотония
B3GALNT2 Мышечная дистрофия-дистрогли канопатия
B4GALT1 Врожденное нарушение гликозилирования
B4GAT1 Мышечная дистрофия-дистрогли канопатия
BCKDHA Болезнь кленового сиропа
BCKDHB Болезнь кленового сиропа
BCS1L Синдром Бьёрнстада; синдром Ли; Дефицит митохондриального комплекса 111; синдром GRACILE
BRAF Синдром LEOPARD
BRAT1 Неонатальный синдром ригидности и мультифокальных судорог
BTD Дефицит биотинидазы
BUB1B Синдром различной мозаичной анеуплоидии
C120RF57 Синдром Темтами
C50RF42 Синдром Жубер
CACNA1A Ранняя эпилептическая энцефалопатия; семейная гемиплегическая мигрень; спиноцеребеллярная атаксия
CACNA1H Идиопатическая генерализованная эпилепсия
CASC5 Первичная микроцефалия
CASK Умственная отсталость и микроцефалия с мосто-мозжечковой гипоплазией; FG-синдром
CASR Гипокальциемия с синдромом Бартера; гипокальцурическая гиперкальцемия
CC2D2A Синдром Жубер; синдром Меккеля; СОАСН-синдром
CCDC88C Спиноцеребеллярная атаксия
CCND2 Синдром мегалэнцефалии-полимикрогирии-полидактилии-гидроцефалии
CDK5RAP2 Первичная микроцефалия
CDK6 Первичная микроцефалия
CDKL5 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
CDON Голопрозэнцефалия
CENPE Первичная микроцефалия
CENPJ Первичная микроцефалия; синдром Секкеля
CEP135 Первичная микроцефалия
CEP152 Первичная микроцефалия; синдром Секкеля
CEP164 Нефронофтиз
CEP290 Синдром Жубер; синдром Барде-Бидля; амавроз Лебера; синдром Сеньор-Локена
CEP41 Синдром Жубер
CEP63 Синдром Секкеля
CERS1 Прогрессирующая миоклоническая эпилепсия
CHD2 Эпилептическая энцефалопатия, детская
CHMP1A Мосто-мозжечковая гипоплазия
CHRNA2 Аутосомно-доминантная ночная лобнодолевая эпилепсия
CHRNA4 Аутосомно-доминантная ночная лобнодолевая эпилепсия
CHRNB2 Аутосомно-доминантная ночная лобнодолевая эпилепсия
CLCN2 Идиопатическая генерализованная эпилепсия
CLIC2 Х-сцепленная умственная отсталость
CLN3 Нейрональный цероидный липофусциноз
CLN5 Нейрональный цероидный липофусциноз
CLN6 Нейрональный цероидный липофусциноз
CLN8 Нейрональный цероидный липофусциноз
CNTN2 Семейная миоклоническая эпилепсия
CNTNAP2 Синдром фокальной кортикальной дисплазии
COA5 Кардиоэнцефаломиопатия
COG1 Врожденное нарушение гликозилирования
COG4 Врожденное нарушение гликозилирования
COG5 Врожденное нарушение гликозилирования
COG6 Врожденное нарушение гликозилирования
COG7 Врожденное нарушение гликозилирования
COG8 Врожденное нарушение гликозилирования
COL18A1 Синдром Кноблоха
COL4A1 Порэнцефалия; Наследственная ангиопатия с нейропатией, аневризмами и крампи; болезнь малых сосудов головного мозга
COL4A2 Порэнцефалия
COQ2 Дефицит коэнзима Q10
COQ4 Дефицит коэнзима Q10
COQ6 Дефицит коэнзима Q10
COQ9 Дефицит коэнзима Q10
COX10 Синдром Ли
COX14 Дефицит ферментов митохондриального комплекса IV
COX15 Синдром Ли
COX20 Дефицит ферментов митохондриального комплекса IV
COX6B1 Дефицит ферментов митохондриального комплекса IV
CPA6 Семейные фебрильные судороги; семейная височнодолевая эпилепсия
CPS1 Дефицит карбамойлфосфат синтетазы 1
CPT1A Дефицит карнитин палмитоилтрансферазы
CPT2 Дефицит карнитин палмитоилтрансферазы
CREBBP Синдром Рубинштейна-Тейби
CSPP1 Синдром Жубер
CSTB Прогрессирующая миоклонус-эпилепсия
CTSA Галактосиалидоз
CTSD Нейрональный цероидный липофусциноз
CTSF Нейрональный цероидный липофусциноз
CUL4B Х-сцепленная умственная отсталость
DARS Гипомиелинизация с поражением ствола головного мозга и спинного мозга и спастичность ног
DBT Болезнь кленового сиропа
DCHS1 Синдром Ван Мальдергема
DCX Лиссэнцефалия
DDOST Врожденное нарушение гликозилирования
DEPDC5 Семейная фокальная эпилепсия
DGUOK Синдром истощения митохондриальной ДНК
DHCR24 Десмостеролоз
DHCR7 Синдром Смита-Лемли-Опица
DLD Дефицит дигидролипоамид дегидрогеназы
DLG3 Х-сцепленная умственная отсталость
DNA2 Синдром Секкеля; прогрессирующая наружняя офтальмоплегия
DNAJC5 Нейрональный цероидный липофусциноз
DNM1 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
D0CK7 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
D0CK8 Умственная отсталость
DOLK Врожденные нарушения гликозилирования
DPAGT1 Врожденные нарушения гликозилирования
DPM1 Врожденные нарушения гликозилирования
DPM2 Врожденные нарушения гликозилирования
DPM3 Врожденные нарушения гликозилирования
DPYD Дефицит дегидропиримидин дегидрогеназы
DYNC1H1 Болезнь Шарко-Мари-Тута и умственная отсталость
DYRK1A Умственная отсталость
EARS2 Дефицит комбинированного окислительного фосфорилирования
EEF1A2 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
EFHC1 Юношеская миоклоническая эпилепсия
EIF2B1 Лейкоэнцефалопатия с исчезновением белого вещества
EIF2B2 Лейкоэнцефалопатия с исчезновением белого вещества
EIF2B3 Лейкоэнцефалопатия с исчезновением белого вещества
EIF2B4 Лейкоэнцефалопатия с исчезновением белого вещества
EIF2B5 Лейкоэнцефалопатия с исчезновением белого вещества
EMX2 Шизэнцефалия
EPM2A Прогрессирующая миоклонус эпилепсия
ETFA Глутаровая ацидемия
ETFB Глутаровая ацидемия
ETFDH Глутаровая ацидемия
ETHE1 Этилмалоновая энцефалопатия
EX0SC3 Мостомозжечковая гипоплазия
EZH2 Синдром Вивера
FA2H Спастическая параплегия
FAM126A Лейкодистрофия
FASTKD2 Дефицит ферментов митохондриального комплекса IV
FAT4 Синдром Хеннекама; синдром Мальдергема
FGD1 Х-сцепленная умственная отсталость; синдром Аарскога-Скотта
FGFR3 SАDDАN-синдром; синдром Кроузона
FH Дефицит фумаразы
FIG4 Болезнь Шарко-Мари-Тута; билатеральная заднепроекционная полимикрогирия
FKRP Мышечная дистрофия-дистрог л иканопатия
FKTN Мышечная дистрофия-дистрогликанопатия
FLNA Перивентрикулярная гетеротопия; FG-синдром; синдром Мельника-Нидлс
FOLR1 Нейродегенерация, связанная с нарушением транспорта фолатов
FOXG1 Синдром Репа, врожденный
FOXRED1 Синдром Ли
FUCA1 Фукозидоз
GABRA1 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
GABRB3 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
GABRD Идиопатическая генерализованная эпилепсия
GABRG2 Генерализованная эпилепсия с фебрильными судорогами
GALC Болезнь Краббе
GALNS Мукопол исаха ридоз
GAMT Синдром дефицита церебрального креатина
GATM Синдром дефицита церебрального креатина
GCDH Глутариацидурия
GCH1 Гиперфенилаланинемия
GCK Неонатальный сахарный диабет
GCSH Глициновая энцефалопатия
GFAP Болезнь Александера
GFM1 Комбинированный дефицит окислительного фосфорилирования
GJC2 Гипомиелинизирующая лейкодистрофия
GLB1 GM-1 ганглиозидоз; мукополисахаридоз
GLDC Глициновая энцефалопатия
GLl2 Голопрозэнцефалия; синдром Куллер-Джонса
GLl3 Синдром Паллистера-Холла; синдром цефалополисиндактилии
GLRA1 Гиперэксплексия
GLRB Гиперэксплексия
GMPPB Мышечная дистрофия-дистроглика нопатия
GNA01 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
GNE Сиалурия
GNPTAB Муколипидоз
GNPTG Муколипидоз
GNS Мукополисахаридоз
G0SR2 Прогрессирующая миоклонус эпилепсия
GPC3 Синдром Симпсона-Голаби-Бемеля
GPHN Дефицит кофактора молибдена
GRIA3 Х-сцепленная умственная отсталость
GRIN1 Умственная отсталость
GRIN2A Фокальная эпилепсия с расстройством речи
GRIN2B Ранняя эпилептическая энцефалопатия
GRN Первичная прогрессирующая афазия; нейрональный цероидный липофусциноз
GUSB Мукополисахаридоз
HADH Дефицит 3-гидроксиацил-СоА дегидрогеназы; семейная гиперинсулинемическая гипогликемия
HCFC1 Х-сцепленная умственная отсталость
HCN1 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
HDAC8 Синдром Корнелии де Ланге; синдром Вильсона-Турнера
HEPACAM Мегалэнцефалическая лейкоэнцефалопатия
HERC2 Умственная отсталость
HEXA Болезнь Тея-Сакса; GМ2-ганглиозидоз
HEXB Болезнь Сандхоффа
HGSNAT Мукополисахаридоз
HPD Тирозинемия
HSD17B10 Х-сцепленная умственная отсталость
HSPD1 Гипомиелинизирующая лейкодистрофия; спастическая параплегия
HYAL1 Мукополисахаридоз
IDS Мукополисахаридоз
IDUA Мукополисахаридоз
IER31P1 Синдром микроцефалия, эпилепсия и сахарный диабет
IFIH1 Синдром Айкарди-Гутьереса
IL1RAPL1 Х-сцепленная умственная отсталость
INPP5E Синдром Жубер; умственная отсталость
INS Неонатальный сахарный диабет
IQSEC2 Х-сцепленная умственная отсталость
ISPD Мышечная дистрофия-дистроглика нопатия
IVD Изовалериановая ацидемия
KCNA1 Эпизодическая атаксия
KCNA2 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
KCNB1 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
KCNJ1 Синдром Барттера
KCNJ10 Синдром SESAME
KCNJ11 Неонатальный сахарный диабет с судорогами
KCNK18 Мигрень с/без ауры
KCNMA1 Генерализованная эпилепсия и пароксизмальная дискинезия
KCNQ2 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
KCNQ3 Доброкачественная неонатальные судороги
KCNT1 Ранняя эпилептическая энцефалопатия
KCTD7 Прогрессирующая миоклонус эпилепсия
KDM5C Х-сцепленная умственная отсталость
KDM6A Синдром Кабуки
KIAA2022 Х-сцепленная умственная отсталость
KIF2A Кортикальная дисплазия
KIRREL3 Умственная отсталость
LAMA2 Врожденная мерозин-дефицитная мышечная дистрофия
LAMB1 Лиссэнцефалия
MBD5 Аутосомно-доминантная умственная отсталость
MCOLN1 Муколипидоз
MCPH1 Первичная микроцефалия
MECP2 Х-сцепленная умственная отсталость; синдром Репа; ранняя эпилептическая энцефалопатия
NDUFV1 Дефицит ферментов митохонриального комплекса 1
PCCA Пропионатацидемия
PEX2 Нарушение биогенеза пероксисом
PSAP Болезнь Гоше, атипичная; болезнь Краббе; метахроматическая лейкодистрофия
PTCH1 Голопрозэнцефалия
PTEN Синдром Коудена; синдром макроцефалия/аутизм; синдром Банайан-Рили-Рувалькаба
RAB3GAP2 Синдром Варбург
