Главная цель биопсии - уточнить предполагаемый диагноз и определить характер, тип и особенности новообразования. Во время манипуляции врач использует специальные инструменты, которые позволяют производить забор нужных клеток или тканей.
Гистологическое исследование операционного материала – это метод исследования, включающий изготовление гистологических препаратов из материала, полученного при частичном или полном удалении органа или ткани во время операции или биопсии, с последующим изучением их под микроскопом. Гистологическое исследование (изучение специально окрашенного материала с помощью микроскопа) позволяет верифицировать патологический процесс, определить его стадию и степень распространения, наличие метастазов. Основываясь на полученных результатах, лечащий врач определяет, насколько клинический диагноз совпадает с гистологическим, какова дальнейшая тактика ведения пациента. Это единственное "прямое" исследование, с помощью которого удается оценить качественные и количественные характеристики клеток и их взаиморасположение в исследуемом биоматериале, выявить атипию, дисплазию, признаки острого и хронического воспаления, специфические включения и микроорганизмы. Во многих случаях именно патоморфологический диагноз определяет стадию, прогноз и тактику лечения заболевания.
Из образца ткани, полученного при операции, изготавливают множественные срезы, которые окрашивают для отчетливого выявления структур клеток при световой микроскопии. Подготовленные препараты помещают на предметное стекло и изучают под микроскопом.
Изучается структура пораженной ткани, оценивается степень выраженности патологических изменений, клеточный состав в целях определения типа клетки, степени дифференцировки, выявления аномальной пролиферации, что важно для диагностики предраковых состояний, онкологических заболеваний, метастатических поражений, определения злокачественности процесса.
Оценивается степень выраженности воспалительных изменений, возможна дифференциальная диагностика острых и хронических воспалительных процессов, в некоторых случаях возможно установление специфического хронического воспаления (аутоиммунные процессы).
На основании увиденного при микроскопии врач-патоморфолог дает заключение. В нем содержится информация о наличии или отсутствии измененных клеток и/или воспалительного процесса, а также клеточном составе исследуемых образцов. В заключении может присутствовать предварительный или заключительный диагноз, а также микроскопическое описание тканей и найденных клеток.
Метод гистологического исследования  позволяет подтвердить диагноз, предполагаемый по результатам неинвазивного исследования, получить дополнительную информацию для установления особенностей течения, выраженности поражения для определения прогноза и плана лечения.