Бета-2-гликопротеин 1 представляет собой гликозилированный белок плазмы крови, являющийся естественным антикоагулянтом, содержание которого в норме составляет около 150-300 мг/л. Бета-2-гликопротеин является белковым ко-фактором антител к кардиолипину и образует неоантиген, который распознается бета-2-гликопротеин-зависимыми антителами к кардиолипину. Этот антигенный комплекс является основной серологической мишенью при АФС. В эксперименте иммунизация бета-2-гликопротеином индуцирует характерную картину с появлением антител к кардиолипину, значительному увеличению числа резорбций плода, тромбоцитопении и удлинению времени ряда коагулогических тестов.